[口头报告]泛癌必需长非编码RNA的鉴定及调节网络研究

泛癌必需长非编码RNA的鉴定及调节网络研究
编号:39 稿件编号:11 访问权限:仅限参会人 更新:2022-06-28 16:51:47 浏览:200次 口头报告

报告开始:暂无开始时间 (Asia/Shanghai)

报告时间:暂无持续时间

所在会议:[暂无会议] » [暂无会议段]

暂无文件

摘要
        长非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类长度大于200nt且不编码蛋白质的非编码RNA (noncoding RNA, ncRNA)。研究表明,lncRNA通常在生物体内起调节作用,参与众多重要的生物过程,如基因印迹、细胞分化、免疫反应、生长发育、人类疾病及肿瘤发生等,有些lncRNA甚至可以作为癌症诊断和预后的标记物,可见lncRNA的重要性。lncRNA作为调节性ncRNA,与多种生物分子如蛋白质、microRNA (miRNA)和mRNA等发生相互作用,形成复杂的生物调节网络,参与癌症发生发展的调控。但由于lncRNA的序列特征除了不编码蛋白质,在很多方面与mRNA类似,如具有Poly-A,可变剪切等,且lncRNA的数量与mRNA相当,甚至更多,很多物种的lncRNA仍然没有完全确定,尤其是疾病相关的lncRNA及其调节关系仍然没有明确。为此,我们整理了10套癌症相关的全基因组CRISPR筛选数据,涉及33种不同的癌症类型,共938个样本,鉴定出799个泛癌必需蛋白编码基因和97个泛癌必需lncRNA,同时构建基于超几何分布检验和随机游走的必需lncRNA预测模型,获得495个新的泛癌必需lncRNA。另外,基于多组学特征,开发了lncRNA与蛋白编码基因相互作用的预测模型,并搭建基于调节网络的lncRNA功能注释平台ncFANs v2.0,为lncRNA的进一步研究提供了重要分析工具和线索。

        

 
关键字
功能注释,长非编码RNA,调节网络,必需基因,泛癌
报告人
廖奇
医学院副院长 宁波大学

稿件作者
廖奇 宁波大学
发表评论
验证码 看不清楚,更换一张
全部评论