[特邀报告]基于三代平台的单细胞测序新突破

基于三代平台的单细胞测序新突破
编号:6 访问权限:仅限参会人 更新:2022-07-01 13:36:17 浏览:221次 特邀报告

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摘要
单细胞测序自2009年被首次报道至今,已成为了生命科学研究的强大有力工具。目前的单细胞已实现高通量研究,然而主要基于NGS平台,其短读长缺陷成为制约精准检测的瓶颈。三代测序的长读长成为了未来单细胞技术突破的一个重要方向,我们基于TGS测序开发了单细胞转录组测序可以直接检测基因可变剪切,发现新转录本,单细胞基因组可以准确发现肿瘤细胞中大尺度的基因组结构变异,包括ecDNA这类新型的变异结构。这些基于TGS平台的单细胞测序技术大大提升了我们对细胞内分子调控的研究能力。
关键字
三代测序;单细胞基因组测序;单细胞转录组测序
报告人
范小英
研究员 广州实验室

范小英,博士,广州实验室基础研究部研究员。2012年本科毕业于浙江大学植物保护专业,2017年毕业于北京大学,获理学博士学位。2017-2019年在北京大学生命科学学院开展博士后工作。近5年论文31篇,其中一作和共同一作9篇,包括Nature, cell, cell research, science advances, genome biology等国际权威期刊。主要研究方向围绕目前单细胞研究领域的需求,开发基于不同测序平台的单细胞多组学测序技术。进一步地,利用先进的单细胞技术研究发育及疾病过程的细胞及分子变化,全面解析调控细胞谱系变化的各种组学特征,深入研究从干细胞到不同命运分化细胞演变过程的多层次组学参与的调控及决定机制。通过绘制发育及疾病发生细胞的演变图谱,寻找特异性功能形成的细胞基础,为针对性修复组织器官损伤及功能退化的治疗方案奠定基础。

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