肿瘤生物信息学——T细胞与TCR生物信息分析
编号：8
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更新：2022-07-01 13:38:38
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特邀报告
报告开始：2022年07月24日 15:05 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S5] 分会场5 » [S5-2] 精准医学与单细胞测序
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摘要
T细胞是免疫系统中的关键细胞，也是肿瘤免疫的关键靶标，含不同T细胞受体（TCR）的T细胞及不同T细胞亚型的组成对肿瘤发生发展和治疗预后有不同作用。我们针对T细胞亚型预测发展ImmuCellAI和ImmuCellAI-mouse方法，可以从混合转录组中准确预测T细胞为主的各类免疫细胞的比例。同时还针对TCR序列的多样性，开发了TCR序列鉴定方法CATT，构建了目前最大的TCR数据库TCRdb，进一步开发了TCRosetta平台可以对TCR进行多种特征的深入分析和注释，解析TCR库的特征。针对单一T细胞含有2个不同TCR的情况开发了新方法进行鉴定并做了系统分析。
关键字
肿瘤免疫;T细胞;T细胞受体;生物信息方法
报告人
郭安源
教授 华中科技大学郭安源，华中科技大学生命科学与技术学院二级教授、博导，国家自然科学基金委“优青”（2018）、湖北省“杰青”（2020）和教育部“新世纪优秀人才”（2012）计划获得者。主要研究方向为肿瘤生物信息学，包括肿瘤多组学数据挖掘，肿瘤免疫和肿瘤微环境表达调控等的生物信息方法和数据库构建，及其在肿瘤和细胞外囊泡中的应用研究。在Advanced Science、Science Translational Medicine、Nucleic Acids Research、Cancer Research和Bioinformatics等领域主流期刊发表第一及通讯作者（含共同）论文50余篇，其中多篇高被引或热点论文。牵头获2020年教育部高校科学研究优秀成果奖自然科学二等奖，入选爱思唯尔2020中国高被引学者。担任中国抗癌协会肿瘤标志分会肿瘤测序与大数据专家委员会副主任委员，以及中国生物工程学会计算生物学与生物信息分会等多个专业学会委员或常委。
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