RNA可变剪接决定细胞命运的生物信息学研究
编号：85
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更新：2022-07-05 11:22:07
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特邀报告
报告开始：2022年07月24日 15:45 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S5] 分会场5 » [S5-2] 精准医学与单细胞测序
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摘要
细胞作为高等生物的基本结构和功能单位，其命运决定及其背后的调控机制是个体发育与肿瘤研究领域最为关键科的学问题之一。因此，随着高通量测序技术的发展与普及，越来越多的研究聚焦到细胞命运决定这一重点领域，并为此产生了大量的多组学数据，以期系统揭示发育中细胞命运决定的机制。然而，以往的研究多关注特定基因的整体表达水平，而忽略了普遍存在的可变剪接事件及其产生的转录异构体（isoform）。为此，我们长期围绕“算法-模型-机制”的生物信息学研究范式，针对可变剪接的多重调控网络构建、剪接调控密码建立、以及细胞命运决定机制发现等，分别在开发新算法、构建新模型、发现新机制方面做了深入的研究，并揭示了可变剪接的多重调控密码及其参与细胞命运决定的新机制。
关键字
可变剪接；细胞命运决定；多组学数据；机器学习
报告人
徐云刚
教授 西安交通大学徐云刚，西安交通大学基础医学院教授、博导。研究领域为生物信息学，长期围绕基因转录调控，重点关注整合分析多种组学大数据和揭示生物发育及疾病发生机理的关键技术和科学问题，针对RNA可变剪接的多重调控及其参与细胞命运决定的机制进行了全面深入地探索，开发了一系列生物信息学方法和机器学习模型，并在揭示新机制、构建新模型和开发新算法方面取得一系列创新性研究成果。截至目前，主持国家自然科学基金面上项目1项；主持西安交通大学“青年拔尖人才支持计划A类”1项；核心参与国家自然科学基金面上项目4项、美国NIH R01基金4项。获得省级三等和厅级一等科学技术奖各1项，教育部国家奖学金1项；已在Genome Biology、AJHG、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics和Bioinformatics等生物信息学领域SCI期刊发表论著20余篇。
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