游离DNA片段化模式与癌症液体活检中的应用
编号：92
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更新：2022-07-05 11:00:47
浏览：694次
特邀报告
报告开始：2022年07月23日 17:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S1] 分会场1 » [S1-1] 生物医学大数据与人工智能
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摘要
基于血浆游离DNA的癌症诊断技术是目前主流的液体活检技术之一。游离DNA是一种自然降解的短DNA片段。近年来，研究人员发现游离DNA的片段化并非随机，与其组织来源、染色质状态有密切联系。通过对游离DNA末端的深度分析并与表观遗传组学相结合，我们鉴定了一些新型生物标志物，其可以为一些临床现象提供生物学解释（例如来自胎儿的游离DNA比母亲的短），并开发出较为低价的癌症诊断和组织预测的方法。
关键字
游离DNA；癌症诊断；液体活检
报告人
孙坤
研究员 深圳湾实验室孙坤博士，2010年毕业于中国科学技术大学，获得学士学位；2014年毕业于香港中文大学，获得博士学位，之后在香港中文大学完成博士后训练，并于2017年获聘香港中文大学研究助理教授职位。孙坤博士于2019年全职加入深圳湾实验室，担任独立课题组组长，并获得2021年国家重大人才项目。孙坤博士以生物信息学、大数据分析为主要研究方法，研究方向集中在癌症诊断、无创产前诊断、原癌基因调控等领域，代表性工作包括首创游离DNA的组织溯源以及肿瘤组织预测方法、揭示游离DNA的生物学特性与分子机理、揭示原癌基因与lncRNA新的相互调控模式等。孙坤博士共发表论文50篇，其中第一作者或通讯作者（含共同）论文30篇（10篇发表于中科院1区期刊，包括Cancer Discovery、PNAS、Genome Research、The EMBO Journal、Nature Communications等），总被引用3500次，H-index为29。孙坤博士目前担任BMC Cancer杂志的编辑，并为多家知名SCI杂志审稿。此外，孙坤博士申请了6项国际专利（其中3项已获得授权）、1项国内专利，大部分专利已转让给癌症诊断领域内的多家国际知名公司（如GRAIL）。
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