线粒体DNA体细胞突变研究和细胞谱系示踪应用
编号：95
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更新：2022-07-01 13:05:50
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特邀报告
报告开始：2022年07月23日 15:40 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S3] 分会场3 » [S3-1] 系统生物学与分子进化
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摘要
线粒体是真核生物细胞中产生能量、提供代谢稳态的重要细胞器。研究发现线粒体对于淋巴免疫细胞的发育、分化和免疫功能具有重要作用。线粒体功能主要依赖于线粒体基因组编码基因的正确调控和表达。线粒体DNA突变的累积将导致线粒体功能的异常，从而影响细胞正常的生理活动和功能。
我们通过对高通量的单细胞染色质开放性测序数据中线粒体DNA序列的定量分析，发现在淋巴免疫细胞中线粒体DNA突变具有特异的突变频谱。通过单细胞转录组测序数据中线粒体复制酶与细胞周期相关基因表达在B细胞发育中的非同步性，建立了线粒体在细胞间遗传的稀释模型。通过群体遗传模型模拟估计，表明淋系免疫细胞特异的突变频谱，可通过发育过程中线粒体DNA遗传瓶颈效应解释。
此外，通过高通量的单细胞测序数据的分析，我们也验证了线粒体DNA突变可作为内源的分子谱系示踪标记，并且可用于单细胞多个体混合测序的分子标签。
我们通过对高通量的单细胞染色质开放性测序数据中线粒体DNA序列的定量分析，发现在淋巴免疫细胞中线粒体DNA突变具有特异的突变频谱。通过单细胞转录组测序数据中线粒体复制酶与细胞周期相关基因表达在B细胞发育中的非同步性，建立了线粒体在细胞间遗传的稀释模型。通过群体遗传模型模拟估计，表明淋系免疫细胞特异的突变频谱，可通过发育过程中线粒体DNA遗传瓶颈效应解释。
此外，通过高通量的单细胞测序数据的分析，我们也验证了线粒体DNA突变可作为内源的分子谱系示踪标记，并且可用于单细胞多个体混合测序的分子标签。
关键字
scATAC-seq， 线粒体DNA突变
报告人
徐锦
教授 中山大学生命科学学院徐锦，中山大学“百人计划”引进人才，获得国家级人才计划（青年项目）支持，生命科学学院教授。主要研究方向为基因表达在演化、发育和疾病中的调控机制。以计算生物学和基因组学为手段，研究和探索了包含表观遗传学修饰、转录调控和转录后调控等多个层次的调控机制。课题组以单细胞测序、计算生物学和功能基因组学技术为主要研究手段，探索神经系统发育、衰老和疾病过程中的分子调控机制。
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